Образован в 1990 году на основании решения Совета Министров РСФСР от 28 мая 1990 г. №172, этому предшествовали десять лет становления на базе факультетов Елабужского государственного педагогического института (педфака, дошфака, худграфа).

В настоящее время в институте трудится около 270 преподавателей, из которых почти половина имеют ученую степень докторов и кандидатов наук. В вузе 7 факультетов, 19 кафедр, лаборатории, которые оснащены современной аппаратурой и компьютерными классами, что позволяет проводить обучение на высоком профессиональном уровне.
Обучение проводится в двух корпусах. В каждом корпусе имеются: актовые залы, библиотеки, столовые. В Набережночелнинском государственном педагогическом институте имеются 3 спортивных зала, где действуют спортивные секции.
Для иногородних студентов предоставляются места в студенческом общежитии.
НГПИ готовит специалистов по следующим основным специальностям:
- "Педагогика и методика начального образования", "Педагогика и психология" (русский и татарский факультеты). Форма обучения- очная и заочная.
- "Дошкольная педагогика и психология", "Социальный педагог". Форма обучения -очная и заочная.
- "Изобразительное искусство" . Форма обучения - очная и заочная.
- "Учитель татарского языка и литературы" и "Учитель русского языка и литературы", а также заочное отделение по специальности "Учитель татарского языка и литературы".
- "Учитель математики и информатики".
- "Учитель информатики и машин".

Учитывая большую потребность школ в учителях географии, биологии, экологии в 1992 г. был открыт географический факультет, а в 2001 г. заочное отделение.
В 1997 г. был создан факультет иностранных языков, который готовит учителей английского и немецкого языка.
При НГПИ имеется аспирантура по следующим специальностям:
13.00.01 - общая педагогика, история педагогики и образования;
13.00.02 - теория и методика обучения и воспитания (математика);
25.00.25 - геоморфология и эволюционная география. 10.01.02 - литература народов РФ (татарская литература).